Все правильно, вы установили сторонний скрипт меню который не имеет никакого отношения к системному, вы вносите изменения в конструкторе меню и ждете, что эти изменения появятся в вашем скрипте, связи с скриптом никакой нет, ноые изменения будут лишь в вертикальном меню, чтобы изменения были в скрипте который вы установили, все нудно добавлять вручную, не через конструктор меню.