Убирать ничего не стоит. В файле роботс прописаны директивы для блокирования системных страниц и запрета к индексации страниц дублей. То что вам сообщает робот об этом, это правильно так как задача робота поисковиков уведомить вас о том, что есть такие страницы которые заблокированы для индексации в файле роботс. Они запрещены так как они не должны индексироваться так как являются мусором, дублями и системными страницами. Удалять директивы не нужно, не нужно угождать роботу поисковиков открывая ему полный доступ для индексации дублей и мусора, в итоге если такое сделать в поиске появится много мусора из-за которого ваш сайт в дополнение может попасть под фильтры так как сотни / тысячи дублей не есть хорошо. Оставьте все как есть и не стоит удалять ничего с файла роботс, разве что можете удалить:
Disallow: /shop/printorder/
Disallow: /shop/checkout/
Disallow: /shop/user/
у вас модуля магазин нет и это вам не нужно.