Просто робот яндекса откопал страницы сайта без ЧПУ, вот он с них и нашел редирект на страницы с ЧПУ. По сути это одна и та же страница и ничего делать не нужно и запрещать индексировать эти страницы также не нужно, редирект есть, далее просто произойдет склейка урлов и все будет хорошо.