Все работает, просто вы надублировали много комментариев в одно время и с тем же содержанием и не понимаете теперь где новый и где старый.
В том случае если на сайте отключено социальное комментирование, переходите в настройки каждого из модулей которые у вас активны и ищите сортировку комментираев как показано на скриншоте