Здесь тоже самое. Давайте разберем:
стало http://ваш.сайт/main_catalog/catalog1/ваша_статья
http://Ваш.сайт - с этим все понятно
main_catalog - Каталог модуля (Ознакомьтесь с системой uCoz, мой Вам совет). Моудль "Каталог статей" имеет дирректорию publ что естественно будет выглядеть как "ваш.сайт/publ"
catalog1 - Тоже самое. В модуле создаете категорию, и прописываете URL для него (допустим catalog1)
ваша_статья - Добавляете статью, ей будет приписываться уникальный URL (простого вида, или с ЧПУ)
Вот и получается то что Вы написали.
Что бы изменить все остальные URL (допустим стандартную дерикторию модуля "Каталог Статей" ex. publ) Нужно подключать SEO модуль для этого, и Вы сможете имзенить publ на свое