1. Хуже не будет точно, если прописан свой код для каноникал и включен в Seo-модуле, то смело можете удалить свой прописанный вручную, автоматически вставляется следующий код с модуля Seo:
<?$SEO_CANONICAL$?>
если на странице категории нет, то просто вручную в блоке <head> установить.
2. Данный редирект, чисто для пользователей которые торгуют ссылками в Sape, ранее многие пользователи пользовались Sape и торговали ссылками, были проиндексированы страницы пагинации по старым урлам, чтобы ссылки не отвалились в сапе, специально был создан данный пункт, для других целей его использовать не нужно.
Если вы в сапе не торговали ранее ссылками до релиза модуля Seo данный пункт у вас должен быть отключен.
Контент-модули
Продвижение сайта
Управление сайтом