В верхней части отображается горизонтально, так как стили заданы соответствующие, вы создайте с помощью конструктора новый блок и добавьте в него код:
<?if($NMENU_1$)?>$NMENU_1$<?endif?>
и увидите, что меню будет отображаться вертикально, в шапке сайта заданы соответствующие стили для такого отображения.