Если это встроенное меню которое выводится с помощью кода:
<?if($SMENU_1$)?><!-- <bc> -->$SMENU_1$<!-- </bc> --><?endif?>
чтобы активные пункты выделялись, нужно перейти в конструктор меню перейдя по ссылке - http://ваш-сайт/panel/?a=menus далее отредактировать пункты и установить относительный урл для каждого пункта.
То есть если у вас для главной указан полный урл http://site.ru/ нужно заменить на /
Далее по модулям:
новости - /news/
статьи - /publ/
блог - /blog/
каталог файлов - /load/
итд, думаю все понятно, например если у вас имеется много страниц с модуля редактор страниц на подобии обратной связи - http://ваш-сайт/index/0-3 удаляем все лишнее и оставляем только /index/0-3 и так во всем меню для каждого пункта проделать.
Это если правильно называть, меняем Абсолютный урл, на относительный, то есть с полного на не полный корневой.