Если в первом контейнере нет кода то есть он полностью пусть.
Перейдите в Настройки - Общие настройки - Дизайн сайта - Ставим галку на Обновить текущий дизайн во всех используемых модулях - Внизу сохраняем. После должен восстановиться глобальный блок с разметкой и стандартными блоками.
Перед всем этим не мешало бы создать резервную копию на случай если вы захотите все вернуть назад как было прежде - Перед изменениями, обязательно перейти в Панель управления - Главная - Дизайн - Резервное копирование шаблонов - Создать резервную копию.