Question

При создании категорий на сайте появились непонятные и не нужные папки этих категорий.

Каким образом можно сделать так, чтобы они не отображались там, а были в боковом меню???

Answer 1

Перейдите на главную интернет-магазина - http://ваш-сайт.ру/panel/?a=tmpl;m=20;t=1 далее найдите код:

<?$CATALOG$(2,5)?>

который и отвечает за вывод этих папок, если они вам ненужны, удалите и сохраните изменения, а категории в боковом контейнере останутся.