Так и будет, чтобы везде установился одинаковый дизайн, перед установкой нужно активировать все модули которыми планируете пользоваться. А если вы делаете как вот у вас сейчас, установили дизайн и после активируете модуль, соответственно в модуля будет стандартный дизайн который был выбран изначально еще перед установкой своего, то есть системный.
Проще сделать следующее если у вас все уже настроено, создайте тестовый сайт, не загружайте изображения если вы покупали шаблон, просто перейдите в конструктор шаблонов и установите шаблон, только перед этим обязательно активируйте все модули.
После установки, переходим в управление дизайном и перекопируем исходный код с нужных вам модулей и устанавливаем на вашем действующем сайта.
Контент-модули
Продвижение сайта
Управление сайтом