Конвертируйте все файлы exe в pdf и закачайте их,например, на диск яндекса (т.к. на сайт возможно закачать файлы объемом не более 15мб) и в Каталоге файлов при добавлении материала разместите ссылку на файл pdf. Тогда в материале появится: скачать удаленно. Пользователь нажимает, открывается отдельная страница с вашим файлом.