Удалите файлов 5 в текущей директории и создавайте новую папку, вверху файлового менеджера имеется кнопка Создать папку, создадите, после переходим в нее и загружаем файлы.
Советовал бы делать следующее, не стоит сразу же загружать все файлы в корень файлового менеджера, создаете оду папку например с название pictes, в которой создаете подпапки много сколько вам нужно и далее в них загружаем файлы. Я именно так и поступаю, корень фтп не засорен 200-т файлами как это вышло у вас, все упорядочено и отсортировано по тематикам, в одних папках изображение по одной тематике, в других другие.
Попробуйте сделать подобное, создадите папку, не лейте в нее сразу же 200 файлов чтобы после создать еще одну папку, создайте в ней 10-к подпапок и после грузите файлы.