Отсутствовать может лишь в том случае если вы в корень сайта или же в текущую папку загрузили 200 файлов, чтобы кнопка появилась снова, для примера удалите файла 3-4 с текущей папки.
После обновите страницу файлового менеджера, появится кнопка Создать папку, нажав на которую создаем новую папку например pictes и в ней еще дополнительных штук 10 после в нее загружаем файлы.